Das Gebäude war über Jahrhunderte Sitz der "Schule" (laizistische Bruderschaft) der Flagellanten von Santa Maria dei Battuti und liegt angrenzend an die gleichnamige Kirche. Entstanden in Mittelitalien im Jahr 1260, verbreitete sich die Bewegung der Flagellanten rasch nach Norden. Die Gründung der Bruderschaft in Belluno und die Erstellung des entsprechenden Matrikels datieren auf das Jahr 1310.
Im Jahr 1978 wurden zunächst die Akten des Militärbezirks erworben, gefolgt von denen der Präfektur, während eine große Anzahl von Übertragungen im Laufe der 90er Jahre erfolgte. Im Jahr 1994 hat das notarielle Archiv des Bezirks die Akten der Notare von Belluno und der Provinz, die vom 15. Jahrhundert bis zur napoleonischen Zeit beurkundet wurden, übergeben.
Es fanden zudem erhebliche Übertragungen aus den Staatsarchiven von Venedig (Podestà und Capitano von Belluno; ASBL - Podestà und Capitano von Belluno, sogenannter napoleonischer Kataster; Personenstandsunterlagen; Matrikelrollen des Militärbezirks), Treviso (Bruderschaften und Körperschaften; Livinallongo-Ampezzo) und Trient (sogenannter österreichischer Kataster, Reihen K und OC) statt.
Das Archiv hat zudem einige Archivbestände von Privatpersonen erworben, die von erheblichem Interesse für die Geschichte der Provinz Belluno sind, wie die der Familien Doglioni, Miari und der Banca Prosdocimi. Die letzten Übertragungen (2002) betreffen schließlich das Dokumentenerbe einiger wichtiger religiöser Körperschaften, die im Belluneser Raum aufgehoben wurden, ebenfalls aus dem Staatsarchiv von Venedig.
