Es wird erzählt, dass sie mit gerade einmal zehn Monaten plötzlich vom Himmel die Fähigkeit erhielt zu sprechen, um ihren Vater von einer schlechten Tat abzuhalten. Im Alter von fünf Jahren hatte sie durch göttliche Inspiration bereits das Geheimnis der Eucharistischen Gegenwart verstanden. Schon als Kind lernte sie hervorragend Latein, ohne die Hilfe von Lehrern oder Nachhilfen.
Als sie gerade sechs Jahre alt war, starb ihre Mutter im Jahr 1612, und 1615, weil ihr Vater sich nicht angemessen um ihre Erziehung kümmern konnte, brachte er sie nach Trient in das Kloster Santa Chiara, das von den Klarissen geleitet wurde, die Bonomo eine Erziehung gemäß den Bräuchen der damaligen Zeit gaben, die auf Religion, Literatur, Musik, Stickarbeiten und Tänzen basierte.
Mit nur neun Jahren, also in einem außergewöhnlichen Alter für diese Zeit, wurde sie zur ersten Kommunion zugelassen. Bei dieser Gelegenheit legte Giovanna Maria ein Gelübde der Jungfräulichkeit ab, zu dem sie ihr ganzes Leben lang treu blieb.
Im Alter von zwölf Jahren schrieb Maria ihrem Vater ihren Wunsch, eine Clarisse zu werden und in Trient zu bleiben. Giovanni Bonomo versuchte zunächst alles, um der Berufung seiner Tochter entgegenzuwirken, brachte sie zurück nach Asiago, um sie auf ein eheliches Leben vorzubereiten, aber schließlich willigte er in ihren Wunsch ein, behielt sich jedoch vor, den Orden und das Kloster persönlich auszuwählen.
In der Kirche Santa Chiara in Trient war sie Novizin, und an Sonntagen begleitete sie die Messe mit dem Klang der Geige, was zahlreiche Menschen in die kleine Kirche außerhalb der Stadtmauern zog.
Endlich, im Alter von fünfzehn Jahren, trat Maria am 21. Juni 1621 in das Benediktinerkloster San Girolamo in Bassano ein. Ihr wurde der Name Giovanna Maria gegeben, und am 8. September 1622 legte sie die Gelübde der Armut, Keuschheit und Gehorsam ab. Sie begann dann den Weg zur Vollkommenheit, indem sie den drei traditionellen Wegen folgte: reinigend, erleuchtend und empfindend. Ihr Leben war geprägt von himmlischen Visionen, und etwa sieben Jahre lang hatte sie „viele Gnaden“ und konnte himmlische Freude genießen, insbesondere in ihren häufigen mystischen Erfahrungen, die intensiver wurden, wenn sie die Kommunion empfing.
Das Privileg, den Höhepunkt der göttlichen Erfahrung zu erreichen, den Dialog mit dem Erlöser zu führen, brachte auch große Prüfungen im Körper und im Geist mit sich. Mit zwanzig Jahren, während eines ihrer gewohnten Ekstasen, legte Jesus ihr einen Ring des mystischen Hochzeitsversprechens an den Finger. Von da an erlebte sie für einige Jahre von Donnerstag Nachmittag bis Freitag Abend oder Samstag Morgen in Ekstase alle Momente und alle Schmerzen der Passion Christi. Sie erhielt sogar die Stigmata.
Diese Phänomene erfüllten sie einerseits mit Freude, doch andererseits quälten sie, weil sie sie den Augen der anderen als „das, was sie nicht ist“ erscheinen ließen, wie sie selbst sagte. Sie betete intensiv, bis ihr die Gnade gewährt wurde, dass die Stigmata verschwanden und die Ekstasen nur noch nachts stattfanden, was ihr erlaubte, ein normales Leben im Kloster zu führen. Sie hatte auch die Gabe der Bilokation.
Die Ruhmeszeit ihrer Heiligkeit breitete sich aus und zog den Unmut einiger Mitschwestern, des Beichtvaters und der Kurie von Vicenza auf sich, die ihr sieben Jahre lang verbot, das Gesprächszimmer zu betreten und Briefe zu schreiben. Sogar der Beichtvater hielt sie für „verrückt“ und ging so weit, ihr die Kommunion zu verweigern, bis eines Tages die heilige Hostie von einem Engel zu ihr gebracht wurde. In dieser Zeit wurde sie auch von körperlichen Krankheiten betroffen: von periodischen Fiebern und später chronischen, Ischias usw.
Die Situation änderte sich in den letzten zwanzig Jahren ihres Lebens. Ihnen wurde erlaubt, die Korrespondenz wieder aufzunehmen, und sie wurde im Juni 1652 zur Äbtissin gewählt. Am 1. August 1655 wurde sie zur Priorin gewählt und blieb bis 1664, als sie erneut zur Äbtissin gewählt wurde. Sie lehrte die Nonnen, dass Heiligkeit nicht darin besteht, große Dinge zu tun, sondern einfache und gewöhnliche Dinge perfekt zu erfüllen.
Viele, auch Adelige, suchten ihren Rat und viele Bedürftige profitierten von ihrer großen Nächstenliebe, eine Tugend, die zusammen mit Demut und heldenhafter Geduld die Merkmale ihres Lebens war.
Aber sie war bereits alt, voller Verdienst, aber auch mit Schmerzen beladen, unter deren Gewicht sie schließlich in Bassano am 1. März 1670 auf die müden Knie sank.
Der Mittelpunkt ihrer Spiritualität, die in der franziskanischen Schule begann und in der benediktinischen vollendet wurde, jedoch mit karmelitischen und ignatianischen Einflüssen, ist um die Figur Christi, den mystischen Bräutigam, zentriert, der in den bedeutendsten Phasen seines irdischen Lebens angesehen wird, was auch aus ihren Schriften hervorgeht, zu denen die „Meditationen über die Passion unseres Herrn Jesus Christus“ und die zahlreichen erhaltenen Briefe von besonderer Bedeutung sind.
Viele wunderbare Heilungen wurden ihrer Fürbitte zugeschrieben, sodass 1699 das Seligsprechungsverfahren eingeleitet wurde, das am 9. Juni 1783 mit ihrer feierlichen Seligsprechung durch Pius VI endete, was große Freude in der Bevölkerung ganz Venetien, insbesondere in Asiago und Bassano hervorrief, die sie als Patrons begrüßten.
Das letzte Wunder trat gerade in ihrer Heimat während des Ersten Weltkriegs auf, als trotz der heftigen Bombardierungen, die ganz Asiago zerstörten, die 1908 ihr gewidmete Statue vor ihrem Geburtshaus unerklärlicherweise unversehrt blieb.
Sie wird am 26. Februar gefeiert.