Das Baptisterium von San Giovanni steht links vom Dom. Es wurde wahrscheinlich auf den Ruinen eines heidnischen Tempels im 7. Jahrhundert erbaut und bleibt das einzige Beispiel romanischer Architektur in Treviso. Das Gebäude wurde mehrfach umgebaut und restauriert und erhielt erst 1935 sein ursprüngliches Aussehen zurück. Über Jahrhunderte war das Gebäude das einzige Baptisterium der Stadt, aber aufgrund seines rechteckigen Grundrisses wird vermutet, dass es ursprünglich als Kirche konzipiert war.
Die Hauptfassade zeichnet sich durch ein Lunette mit einem Relief aus dem 14. Jahrhundert aus, das die Enthauptung von Johannes dem Täufer darstellt, während sich auf der zur Kathedrale gewandten Seite zwischen zwei Fenstern die Spuren eines auferstandenen Christus befinden, gemalt von Tizian Vecellio.
Im Inneren erhebt sich im Zentrum das bemerkenswerte Taufbecken aus rotem Veroneser Marmor aus dem späten 16. Jahrhundert. Die Apsiden sind mit kostbaren romanisch-byzantinischen Fresken bereichert.