In längst vergangenen Zeiten, an dem Ort, wo das heutige Heiligtum der Madonna dei Miracoli steht, gab es eine kleine Kirche, die San Pietro in Lamentese gewidmet war, deren alte Ursprünge in der Geschichte verloren gehen. Ihre Präsenz ist jedoch um das 10. Jahrhundert dokumentiert, als der Ort ein kleines Kloster von Benediktinermönchen beherbergte. In den folgenden Jahrhunderten fiel es in einen ruinösen Verfall, der bis 1486 andauerte, als ein Bild der Jungfrau, das an der Südwand der Kirche gemalt war, nachdem es entstellt und beleidigt worden war, sich bewegte und den Beginn einer wunderwirkenden Aktivität markierte. Dieses Ereignis führte zum Bau des Klosters im Gebäude, das wir heute sehen. Später wurde das Gebäude verkauft und wurde zur Sommerresidenz der venezianischen Patrizier, während die Kirche wieder in Verfall geriet.
1826, auf Drängen der Gläubigen, wurde ein Kaplan eingesetzt, und im folgenden Jahr konnte der Gottesdienst wieder aufgenommen werden. Es wurde mit einer beeindruckenden Restaurierungsarbeit begonnen, und die Kirche der Madonna dei Miracoli nahm wieder vollumfänglich ihre Funktion als marianisches Wallfahrtszentrum auf.
Heute wird die Kirche, die 1955 zur Pfarrei erhoben wurde, vom diözesanen Klerus geleitet; begünstigt durch einige päpstliche Privilegien, feiert sie das jährliche Fest, per Dekret des Heiligen Stuhls, am vierten Sonntag nach Ostern.
