È situata sulla linea elettrificata a doppio binario Padova-Bologna e da essa si diramano in direzione est, verso Adria e Chioggia (VE), la Rovigo-Chioggia a binario unico, ed in direzione ovest, verso Legnago e Verona, la Verona-Legnago-Rovigo.
Alla stazione di Rovigo fa capo anche il breve tronco non elettrificato a semplice binario per lo scalo di Rovigo Interporto.
La piazza esterna è il punto di interscambio con le principali linee urbane della Busitalia. Lungo Viale Guglielmo Marconi, il viale antistante, transitano inoltre alcune autolinee extraurbane sempre gestite da Busitalia e si raggiunge l'autostazione situata nel piazzale situato alla Chiesa della Commenda che la collega a tutte le destinazioni provinciali più alcune autolinee nazionali.
Adiacente al fabbricato di stazione vi è il servizio di Taxi.
Servizi:
- Bar
- Biglietteria automatica
- Servizi igienici
- Fermata autobus
- Servizi igienici