La Basilica, costruita con la consulenza di P. Francesco Zorzi, fu consacrata nel 1548 e dichiarata Monumento nazionale nel 1877. Tutto invita alla preghiera, specialmente le notevoli opere d'arte.
Nell'arco trionfale possiamo trovare l' Annunciazione attribuita a Pomponio Amalteo mentre sul primo altare a sinistra un'incantevole Natività di Bernardino d'Asola. Di fronte:possiamo ammirare la pala di S. Nicola attribuita recentemente a Gerolamo Pilotti e al centro della Chiesa, sempre a sinistra, il S. Cuore, pregiata tela del veneziano Luigi Nono; mentre di fronte la bella tela di S. Pietro d'Alcantara di Giovanni Spoldi. Chiude la navata laterale sinistra la Cappella della Madonna.
Per due porticine ai lati dell'altare si scende nella Cripta: è il cuore del Santuario, il luogo dove apparve Maria. Rientrando in Chiesa, nel pilastro sinistro dell'arco trionfale, una piccola nicchia Vergine col Bambino: è il più antico ex-voto donato dal podestà di Motta, Girolamo Venier, graziato dalla Madonna. Sopra l'Altare Maggiore la stupenda Ancona del Sansovino: al centro la porticina del tabernacolo con angeli adoranti: in alto l'Annunciazione; ai lati in basso: S. Francesco e S. Antonio. Sopra la porta principale la policroma vetrata dell'Assunta, opera di Pompeo Bertini di Milano.
Uscendo per la porta laterale destra si entra nel primo chiostro: nelle lunette, in una serie di affreschi di Bernardo Muttoni (1674), è raccontata la Vita di S. Francesco. Per la sottostante porta si entra nel secondo chiostro nelle cui lunette è raccontata la Vita di S. Antonio di Bernardo Muttoni.
