La chiesa venne citata per la prima volta nel 1297 all'internod delle Rationes Decimarum. La chiesa venne costruita probabilmente durante l'epoca degli Ezzelini e l'intitolazione a San Giorgio può essere spiegata col fatto che, durante il medioevo, il santo fu protettore della cavalleria e il suo culto ebbe un larghissimo sviluppo in tutto l'Occidente.
La bellicosa epoca degli Ezzelini da Romano - terminata nel 1259 - potrebbe spiegare tale intitolazione: il territorio di Breganze fu devoto, come tutta la fascia pedemontana, alla grande famiglia guerriera.
Nel 1571 e durante la Visita Pastorale, il vescovo Ormaneto trovò ancora esistente la vecchia chiesetta, che era rimasta immutata. Nel 1770 iniziò la costruzione di quella nuova, che durante la visita pastorale del vescovo Giustiniani nel 1775 era ancora incompiuta. Egli definì quella vecchia "molto angusta" e destinata in parte a diventare la sacrestia una volta terminata la nuova chiesa la quale, anche se incompleta, entrò in funzione nel 1805.
Successivamente, nel 1808 furono terminati la facciata e la pavimentazione, nel 1812 la spaziosa sacrestia.
La parrocchia di San Giorgio, per oltre un millennio legata alla chiesa di Breganze, venne staccata nel maggio 1818 quando Pio VII restituì Breganze alla diocesi vicentina. Nel 1866 e 1867 ai tre altari preesistenti ne furono aggiunti due nuovi. Il campanile, per qualche tempo sostituito da uno in legno, fu ricostruito in pietra e a forma di torre tra il 1821 e il 1828. La consacrazione della chiesa avvenne nel 1889 e l'anno dopo essa divenne arcipretale.
Nel 1962, la chiesa fu restaurata e abbellita. Nel 1992 ebbero inizio i lavori di sistemazione del tetto e della tinteggiatura esterna, nel 1993 ebbero inizio i lavori di restauro del campanile e nel 1994 i lavori di restauro dell'interno.
San Giorgio di Perlena, fino a pochi anni fa, fu sede di vicariato e comprendeva Calvene, Fara, Lugo, Mure, Salcedo e San Giorgio.
